RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	LEFTY2	O00292	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	VNN1	O95497	513 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCF3	P15923	654 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ID4	P47928	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	MXI1	P50539	228 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC8A3	P57103	927 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP46	P62068	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC7A9	P82251	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PNOC	Q13519	176 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCIN	Q13939	588 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT39	Q6A163	491 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q6ZS52	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACD	Q96AP0	544 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55	6e-6	■■■■■ 48.1
NPIPB4-222	ENST00000614197	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMA7	O14818	248 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	LILRB5	O75023	590 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADH1C	P00326	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD58	P19256	250 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SDHB	P21912	280 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GJA4	P35212	333 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FNTB	P49356	437 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	GALK1	P51570	392 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC5A3	P53794	718 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	NELL1	Q92832	810 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TIGD1	Q96MW7	591 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF40	O75150	1001 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC130	P13994	396 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADORA2B	P29275	332 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASPA	P45381	313 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	TUB	P50607	506 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNA2D1	P54289	1103 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXK2	Q01167	660 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC63	Q05C16	580 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CETN1	Q12798	172 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	ORC1	Q13415	861 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	EML3	Q32P44	896 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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