RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598959.5

NOP53-208, Transcript of NOP53 ribosome biogenesis factor, human

TSL 5

Gene NOP53, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP53-208	ENST00000598959	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	GPD1L	Q8N335	351 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	FRMD1	Q8N878	549 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	BPTF	Q12830	3046 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ACACA	Q13085	2346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959		F8VP50	259 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	GCNT3	O95395	438 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	NEFL	P07196	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	FAM163B	P0C2L3	166 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PTGER3	P43115	390 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SLC6A11	P48066	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	DGKE	P52429	567 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	KCNB1	Q14721	858 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	DHCR24	Q15392	516 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	WBP2	Q969T9	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	P2RY11	Q96G91	374 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SPINK2	P20155	84 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PPP3CC	P48454	512 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PDE6C	P51160	858 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SEC13	P55735	322 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	CAPN10	Q9HC96	672 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TRIM66	O15016	1216 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	GJB3	O75712	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	KAT7	O95251	611 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	KRT19	P08727	400 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	KCNA4	P22459	653 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	HOXD12	P35452	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PGF	P49763	221 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	TAF10	Q12962	218 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	NR1H3	Q13133	447 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	PSMD6	Q15008	389 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP53-208	ENST00000598959	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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