RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CA14Q9ULX7 337 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM221A6NGB7 291 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 BECN2A8MW95 431 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HHLA1C9JL84 531 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 M0R296 226 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR37L1O60883 481 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SRFP11831 508 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HDCP19113 662 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FCARP24071 287 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GDI1P31150 447 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 AVPR1AP37288 418 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF165P49910 485 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC5A3P53794 718 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GCNT1Q02742 428 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 NCAPHQ15003 741 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 NFKBIBQ15653 356 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CNGA2Q16280 664 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM31Q5JXX7 168 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 VITQ6UXI7 678 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 MON1AQ86VX9 555 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 YAF2Q8IY57 180 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TFAP2BQ92481 460 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC22A12Q96S37 553 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF38Q9H0F5 515 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 BRD9Q9H8M2 597 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SIX2Q9NPC8 291 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 COMMD8Q9NX08 183 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HESX1Q9UBX0 185 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PATJQ8NI35 1801 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TULP2O00295 520 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3R2O00459 728 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF263O14978 683 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TADA3O75528 432 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAMEF12O95522 483 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CKMP06732 381 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PAEPP09466 180 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L7P0C7H9 530 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP1A3P13637 1013 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LCP1P13796 627 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 NPR3P17342 541 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMC3P17980 439 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP3CCP48454 512 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PGFP49763 221 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 KLK7P49862 253 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC8A3P57103 927 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 UBXN1Q04323 297 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE4CQ08493 712 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC30AQ86WT1 665 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SIX5Q8N196 739 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC8Q8TAM2 541 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 E2F7Q96AV8 911 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ASIC4Q96FT7 647 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms