RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583025.1

SLC16A3-216, Transcript of solute carrier family 16 member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SLC16A3, Length 955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3-216ENST00000583025 PRR23AA6NEV1 266 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 TNFRSF10BO14763 440 aa20.5■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 SLC5A3P53794 718 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 LRMPQ12912 555 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 TAF10Q12962 218 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 WDR44Q5JSH3 913 aa20.5■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.5■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.48■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 LMO3Q8TAP4 145 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 IER2Q9BTL4 223 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 IL37Q9NZH6 218 aa20.48■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 UBR7Q8N806 425 aa20.47■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 FBXO32Q969P5 355 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 GBP4Q96PP9 640 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 RNF38Q9H0F5 515 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 CHRDQ9H2X0 955 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 GKN1Q9NS71 199 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 R4GN57 208 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 F5P12259 2224 aa20.47■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 HDCP19113 662 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 CTHP32929 405 aa20.46■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 ZNF77Q15935 545 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.46■□□□□ 0.87
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SLC16A3-216ENST00000583025 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 HPS4Q9NQG7 708 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 GMIPQ9P107 970 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC16A3-216ENST00000583025 FAM92AA1XBS5 289 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC16A3-216ENST00000583025 OLFM2O95897 454 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC16A3-216ENST00000583025 ABL1P00519 1130 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC16A3-216ENST00000583025 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLC16A3-216ENST00000583025 PDE6CP51160 858 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC16A3-216ENST00000583025 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLC16A3-216ENST00000583025 MTAPQ13126 283 aa20.45■□□□□ 0.86
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