RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PPP2R5DQ14738 602 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 KRT39Q6A163 491 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATRIPQ8WXE1 791 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 TSG101Q99816 390 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 KRT82Q9NSB4 513 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 WNT6Q9Y6F9 365 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-206ENST00000571409 TCF3P15923 654 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 GTF2H1P32780 548 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 IFNAR2P48551 515 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 Q6ZS52 159 aa32.19■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ZBTB44Q8NCP5 570 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC150Q8NCX0 1101 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC2A14Q8TDB8 520 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 NELL1Q92832 810 aa32.19■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CHFRQ96EP1 664 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 NIF3L1Q9GZT8 377 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM49BQ9NUQ9 324 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC5A3P53794 718 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZXDBP98169 803 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 SATB1Q01826 763 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 INCA1Q0VD86 236 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 CPA6Q8N4T0 437 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 C12orf29Q8N999 325 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 RNF38Q9H0F5 515 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 ECT2Q9H8V3 914 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 CYP3A43Q9HB55 503 aa32.18■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 CXCL12P48061 93 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 AMPD2Q01433 879 aa32.17■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SCAMP5Q8TAC9 235 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATP2A3Q93084 1043 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 TWNKQ96RR1 684 aa32.17■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 STX10O60499 249 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 OLFM2O95897 454 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 MXI1P50539 228 aa32.16■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 EML3Q32P44 896 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM196Q5HYL7 178 aa32.16■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 MAP3K7CLP57077 242 aa32.14■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SUMF1Q8NBK3 374 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 FBXL13Q8NEE6 735 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 SMPD4Q9NXE4 827 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 IL37Q9NZH6 218 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYH10P35580 1976 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 CILPO75339 1184 aa32.13■■■□□ 2.73
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CTDNEP1-206ENST00000571409 COMMD8Q9NX08 183 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAB20Q9NX57 234 aa32.13■■■□□ 2.73
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CTDNEP1-206ENST00000571409 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 STIM1Q13586 685 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 WHAMMQ8TF30 809 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 CYFIP2Q96F07 1278 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 P2RY13Q9BPV8 354 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 GMIPQ9P107 970 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-206ENST00000571409 MAN1B1Q9UKM7 699 aa32.12■■■□□ 2.73
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