RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 EHD2Q9NZN4 543 aa22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TULP2O00295 520 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 YWHAQP27348 245 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCAT1P54687 386 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE4CQ08493 712 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARM1Q6UWI2 310 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGF14Q92915 247 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK33Q9BYT3 514 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNK12Q9HB15 430 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 THAP12O43422 761 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLCN1P35523 988 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC8A3P57103 927 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR1I3Q14994 352 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PKDCCQ504Y2 493 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXNDC8Q6A555 127 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIGZQ86VD9 579 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO32Q969P5 355 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL37Q9NZH6 218 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANHXE9PGG2 379 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 F8VZ95 297 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 M0QYV0 167 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBASH3AP57075 661 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 HTR4Q13639 388 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 STILQ15468 1287 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASB16Q96NS5 453 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TASP1Q9H6P5 420 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABL1P00519 1130 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFHP08603 1231 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTK2Q05397 1052 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 KXD1Q9BQD3 176 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 COMMD8Q9NX08 183 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIOO75962 3097 aa22.11■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 MED7O43513 233 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF11P52732 1056 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCD2Q92925 531 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFNKQ9P0W0 207 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 GMIPQ9P107 970 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM92AA1XBS5 289 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf78A6NCI8 922 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SETSIPP0DME0 302 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 FCARP24071 287 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 VIPR2P41587 438 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 JAM2P57087 298 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTSS1LQ765P7 747 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 MON1AQ86VX9 555 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPAG5Q96R06 1193 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PQC6 194 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNFRSF10AO00220 468 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 GFPT2O94808 682 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLA2G4AP47712 749 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP3CCP48454 512 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PGFP49763 221 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS7P49802 495 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB41Q5JT25 222 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC22A12Q96S37 553 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCML2Q9UQR0 700 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 BPIFB4P59827 614 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms