RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 FBXO43Q4G163 708 aa23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 CEP68Q76N32 757 aa23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 SV2AQ7L0J3 742 aa23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 CD101Q93033 1021 aa23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.08■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.08■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 GPR179Q6PRD1 2367 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 KRT13P13646 458 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 NR2F2P24468 414 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 DPYDQ12882 1025 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ACOT1Q86TX2 421 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 FAM35AQ86V20 835 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 TAF4BQ92750 862 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 KCNK16Q96T55 309 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 RNF38Q9H0F5 515 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SDCBP2Q9H190 292 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 CPQQ9Y646 472 aa23.07■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ZNF202O95125 648 aa23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 HOXA6P31267 233 aa23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SLC7A9P82251 487 aa23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 WDR5BQ86VZ2 330 aa23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 OBSL1O75147 1896 aa23.06■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SPTBN4Q9H254 2564 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 AP1G2O75843 785 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 HLA-DRAP01903 254 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 RETP07949 1114 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 PXNP49023 591 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 NDST1P52848 882 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SLC5A3P53794 718 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ZXDBP98169 803 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 LMNB2Q03252 620 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ORC1Q13415 861 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 KRT82Q9NSB4 513 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 FRYLO94915 3013 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 MAPK13O15264 365 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 AKAP3O75969 853 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 HOXC13P31276 330 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 GCLMP48507 274 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SPEM2Q0P670 501 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ADAM9Q13443 819 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.04■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ZNF292O60281 2723 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 TRIM49P0CI25 452 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 TRIM49CP0CI26 452 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 CCDC130P13994 396 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SDHBP21912 280 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 NFIL3Q16649 462 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 HECTD3Q5T447 861 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 UNC93AQ86WB7 457 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 FUKQ8N0W3 1084 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 NACA2Q9H009 215 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.03■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.02■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 OLFM2O95897 454 aa23.02■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 CCDC192P0DO97 292 aa23.02■■□□□ 1.28
CIPC-208ENST00000557115 ASPAP45381 313 aa23.02■■□□□ 1.28
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