RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	CHAD	O15335	359 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	ABL1	P00519	1130 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	CALCA	P01258	141 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	CKM	P06732	381 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	AOC1	P19801	751 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	ZXDB	P98169	803 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	APBA1	Q02410	837 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	TNK2	Q07912	1038 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	PRSS33	Q8NF86	280 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	GMIP	Q9P107	970 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TPCN1-223	ENST00000552985	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	MBD3	O95983	291 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GLUL	P15104	373 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	HDC	P19113	662 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	RFX1	P22670	979 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SOX9	P48436	509 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CETN1	Q12798	172 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SHD	Q96IW2	340 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TULP2	O00295	520 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP26A1	O43174	497 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	OLFM2	O95897	454 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ARSA	P15289	507 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CD19	P15391	556 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC9A1	P19634	815 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP3CC	P48454	512 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	KIF11	P52732	1056 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	USP4	Q13107	963 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF77	Q15935	545 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.88	□□□□□ -0.51

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