RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 MAMLD1Q13495 774 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PPP2R5EQ16537 467 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PTGISQ16647 500 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GNASQ5JWF2 1037 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 IFT20Q8IY31 132 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TFAP2BQ92481 460 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SMC6Q96SB8 1091 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HINFPQ9BQA5 517 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SPC25Q9HBM1 224 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PARVAQ9NVD7 372 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CNTN3Q9P232 1028 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SEPT4O43236 478 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TIMM44O43615 452 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RECQL4O94761 1208 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PROSCO94903 275 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RARBP10826 455 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CD19P15391 556 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NEK2P51955 445 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 EPHB4P54760 987 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NKX3-2P78367 333 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PRKCZQ05513 592 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 INCA1Q0VD86 236 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NOGQ13253 232 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DSG2Q14126 1118 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZBTB6Q15916 424 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 AADACL2Q6P093 401 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NLRP14Q86W24 1093 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TTC39CQ8N584 583 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 BEST2Q8NFU1 509 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 WHAMMQ8TF30 809 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LHX5Q9H2C1 402 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CROTQ9UKG9 612 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HES2Q9Y543 173 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ARHGAP33O14559 1287 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 WFS1O76024 890 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PGK1P00558 417 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PYGMP11217 842 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MAN1A1P33908 653 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 OXCT1P55809 520 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TRIM32Q13049 653 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PAK2Q13177 524 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CBX3Q13185 183 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NNTQ13423 1086 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 UBXN11Q5T124 520 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 EMBQ6PCB8 327 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ERICH1Q86X53 443 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.15□□□□□ -1.1
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