RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 TWNKQ96RR1 684 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 KCNK16Q96T55 309 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 NT5C1AQ9BXI3 368 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 CHRDQ9H2X0 955 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 HPS4Q9NQG7 708 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 KRT82Q9NSB4 513 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 COMMD8Q9NX08 183 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO4Q9UKT5 387 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD8-204ENST00000544999 MYH10P35580 1976 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 TNFRSF10BO14763 440 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CILPO75339 1184 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC130P13994 396 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SLC5A3P53794 718 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 MORC3Q14149 939 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 PDGFRLQ15198 375 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF528Q3MIS6 628 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FOXR2Q6PJQ5 311 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 TXNDC11Q6PKC3 985 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ZMIZ2Q8NF64 920 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO32Q969P5 355 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SMOQ99835 787 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 DNAI2Q9GZS0 605 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FAM49BQ9NUQ9 324 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 IL37Q9NZH6 218 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 COQ4Q9Y3A0 265 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 GFRA3O60609 400 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 OLFM2O95897 454 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 OAS1P00973 400 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 BMP6P22004 513 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SLC7A9P82251 487 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC32Q14392 662 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CBWD6Q4V339 395 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 WDR44Q5JSH3 913 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 MAMSTRQ6ZN01 415 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 TTC39CQ8N584 583 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 C12orf29Q8N999 325 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SH3RF2Q8TEC5 729 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 WHAMMQ8TF30 809 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 OSCP1Q8WVF1 389 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 EBF3Q9H4W6 596 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 BICDL2A1A5D9 508 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FAM92AA1XBS5 289 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 BEST1O76090 585 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ABL1P00519 1130 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FAM200BP0CF97 657 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ARSAP15289 507 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CD58P19256 250 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ADORA2BP29275 332 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 IFNAR2P48551 515 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 MTAPQ13126 283 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 PON2Q15165 354 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 DGKKQ5KSL6 1271 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 KLHL10Q6JEL2 608 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 TTI2Q6NXR4 508 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 KIAA1958Q8N8K9 716 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SCAMP5Q8TAC9 235 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 NELFBQ8WX92 580 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SLC35C1Q96A29 364 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SEMA4AQ9H3S1 761 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 PRR23AA6NEV1 266 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 LEFTY2O00292 366 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 BIN1O00499 593 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K7CLP57077 242 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 AMPD2Q01433 879 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 SNX30Q5VWJ9 437 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ASCL5Q7RTU5 278 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CPA6Q8N4T0 437 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 TRIML1Q8N9V2 468 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 TATDN2Q93075 761 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ATP2A3Q93084 1043 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 RNF38Q9H0F5 515 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO44Q9H4M3 255 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 ECT2Q9H8V3 914 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CTNND2Q9UQB3 1225 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 CPQQ9Y646 472 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD8-204ENST00000544999 PMM2O15305 246 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms