RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 MT-ND3P03897 115 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 EDN1P05305 212 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 PGM1P36871 562 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 CDKN2BP42772 138 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 RAB27AP51159 221 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 STMN2Q93045 179 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ACAP3Q96P50 834 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 RNF146Q9NTX7 359 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 PARVAQ9NVD7 372 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ATP2A1O14983 1001 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 PMM2O15305 246 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ZWINTO95229 277 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 FESP07332 822 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ELK3P41970 407 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 HSD17B4P51659 736 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 FKBP1BP68106 108 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 SLC34A1Q06495 639 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 BMPR2Q13873 1038 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ZACNQ401N2 412 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 FAM160B2Q86V87 743 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 C4orf19Q8IY42 314 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 USP6NLQ92738 828 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 CFAP36Q96G28 342 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 IWS1Q96ST2 819 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 RMDN3Q96TC7 470 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 TLE6Q9H808 572 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ETS2P15036 469 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 GTF2A2P52657 109 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 PTK7Q13308 1070 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 PGM5Q15124 567 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 RASA2Q15283 850 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 CCDC142Q17RM4 750 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 C12orf42Q96LP6 360 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 SERPINB4P48594 390 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 CDK16Q00536 496 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 SKA1Q96BD8 255 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 TRIM11Q96F44 468 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 CAPNS2Q96L46 248 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 THTPAQ9BU02 230 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 17.1
PRAME-214ENST00000543184 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ASB3Q9Y575 518 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-214ENST00000543184 ICAM1P05362 532 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 TNFSF9P41273 254 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 CNTN2Q02246 1040 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 FSTL1Q12841 308 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 MMRN1Q13201 1228 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 ZBTB33Q86T24 672 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 HSPH1Q92598 858 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 SAR1AQ9NR31 198 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 SCOCQ9UIL1 159 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAME-214ENST00000543184 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms