RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536283.1

ARF3-205, Transcript of ADP ribosylation factor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ARF3, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3-205ENST00000536283 RAB23Q9ULC3 237 aa23.56■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 CFAP54Q96N23 3096 aa23.56■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 LEFTY2O00292 366 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 EGFP01133 1207 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 TRIM49P0CI25 452 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 TRIM49CP0CI26 452 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 KRT13P13646 458 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 YWHAQP27348 245 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 ASPAP45381 313 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 ORC1Q13415 861 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 FBXO32Q969P5 355 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 KCNK16Q96T55 309 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.361e-24■■■■■ 211.2
ARF3-205ENST00000536283 KRT82Q9NSB4 513 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.55■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 OLFM2O95897 454 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 GCLMP48507 274 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 GALK1P51570 392 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 NDST1P52848 882 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 SLC7A9P82251 487 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 ZXDBP98169 803 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 LPAL2Q16609 132 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 LONP2Q86WA8 852 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 RNF38Q9H0F5 515 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 GMEB2Q9UKD1 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 CPQQ9Y646 472 aa23.54■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 RNF40O75150 1001 aa23.53■■□□□ 1.36
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ARF3-205ENST00000536283 NFATC1O95644 943 aa23.53■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 CCDC130P13994 396 aa23.53■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 DRD1P21728 446 aa23.53■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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ARF3-205ENST00000536283 ATG13O75143 517 aa23.52■■□□□ 1.36
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ARF3-205ENST00000536283 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.52■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.52■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.52■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.52■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.52■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.52■■□□□ 1.36
ARF3-205ENST00000536283 GPR179Q6PRD1 2367 aa23.52■■□□□ 1.36
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ARF3-205ENST00000536283 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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ARF3-205ENST00000536283 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.51■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.51■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 RMDN1Q96DB5 314 aa23.51■■□□□ 1.35
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ARF3-205ENST00000536283 RMND1Q9NWS8 449 aa23.51■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 SLC8A2Q9UPR5 921 aa23.51■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 TNFRSF10BO14763 440 aa23.5■■□□□ 1.35
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ARF3-205ENST00000536283 HRO43593 1189 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 HOXA6P31267 233 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 CNR2P34972 360 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 NUCB2P80303 420 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 LAIR1Q6GTX8 287 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 C12orf29Q8N999 325 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 SMOQ99835 787 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.5■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 BEST1O76090 585 aa23.49■■□□□ 1.35
ARF3-205ENST00000536283 ADORA2BP29275 332 aa23.49■■□□□ 1.35
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