RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP6R2O75170 966 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP17A1P05093 508 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 TCF3P15923 654 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CASP4P49662 377 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 AMPD3Q01432 767 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 MESP2Q0VG99 397 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 IQUBQ8NA54 791 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 C8orf48Q96LL4 319 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CUEDC2Q9H467 287 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 NUP205Q92621 2012 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 A8MXQ7 604 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 TM4SF5O14894 197 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CUTAO60888 179 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 TACC1O75410 805 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 LIMK1P53667 647 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 TRPC3Q13507 836 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 ELF2Q15723 593 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 VPS45Q9NRW7 570 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 EBF1Q9UH73 591 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CLSTN1O94985 981 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 AFMP43652 599 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 PDE6CP51160 858 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 CDH8P55286 799 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC7A9P82251 487 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 DHCR24Q15392 516 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 ANO7Q6IWH7 933 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 UNC13DQ70J99 1090 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-205ENST00000527952 RHOBTB1O94844 696 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 BCKDHBP21953 392 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF43Q68DV7 783 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 C12orf40Q86WS4 652 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNK16Q96T55 309 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PHACTR2O75167 634 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CAVIN2O95810 425 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 EHHADHQ08426 723 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CUL4BQ13620 913 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 EMC10Q5UCC4 262 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 EHD2Q9NZN4 543 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 YEATS4O95619 227 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 OLFM2O95897 454 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PFKLP17858 780 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 YWHAQP27348 245 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 TIE1P35590 1138 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 KDSRQ06136 332 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 ST3GAL2Q16842 350 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM92Q6UXU6 159 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 SLITRK1Q96PX8 696 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 MED10Q9BTT4 135 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 EDEM2Q9BV94 578 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 MMP17Q9ULZ9 603 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE4BO95155 1302 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 EXOC3O60645 756 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP3CCP48454 512 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 BIRC3Q13489 604 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 NUP93Q8N1F7 819 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 ALLCQ8N6M5 410 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 RLN3Q8WXF3 142 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXO32Q969P5 355 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 MYH10P35580 1976 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 LAMA1P25391 3075 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 C4orf47A7E2U8 309 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 ORC1Q13415 861 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CRY1Q16526 586 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms