RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 NPY5RQ15761 445 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGS1Q32NB8 556 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 AWAT1Q58HT5 328 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 EMC10Q5UCC4 262 aa3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 ABRAQ8N0Z2 381 aa3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOTCH4Q99466 2003 aa3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 C4orf46Q504U0 113 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CATIPQ7Z7H3 387 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 C17orf80Q9BSJ5 609 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 ARMT1Q9H993 441 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 HEY2Q9UBP5 337 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNKSO95271 1327 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 TULP3O75386 442 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL33O95760 270 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 DENND2CQ68D51 928 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE1EQ5T753 118 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 DLK2Q6UY11 383 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.55□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 SPARTQ8N0X7 666 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC15A4Q8N697 577 aa3.55□□□□□ -1.84
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RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX15Q9NRS6 342 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS44E7EML9 344 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 POU2F2P09086 479 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKAR1BP31321 381 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT3P56703 355 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNB1Q14721 858 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 RANBP10Q6VN20 620 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIP4P1Q86T03 277 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MPP5Q8N3R9 675 aa3.54□□□□□ -1.84
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