RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 GPANK1O95872 356 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 CSF1RP07333 972 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT9P35527 623 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFV1P49821 464 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 OCA2Q04671 838 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 TRPC3Q13507 836 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM60Q495X7 471 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 HTRA1Q92743 480 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-205ENST00000514178 ADM5C9JUS6 153 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 AGPSO00116 658 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF185O15231 689 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP6R2O75170 966 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP1A3P13637 1013 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 RXRAP19793 462 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 RAP1GAPP47736 663 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CCR5P51681 352 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PGDP52209 483 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE3AQ05086 875 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC12A1Q13621 1099 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 FHL3Q13643 280 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 E2F2Q14209 437 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC22Q5TAA0 569 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 C3orf49Q96BT1 292 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 MNTQ99583 582 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS16Q9H269 839 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 BTBD11A6QL63 1104 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TAF5LO75529 589 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPN3P20807 821 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 DYRK1AQ13627 763 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNIQ14094 377 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 DLGAP5Q15398 846 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS53Q5VIR6 699 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 HTR3DQ70Z44 454 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 SYT8Q8NBV8 401 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA1Q92805 767 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR20Q99678 358 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM160Q9NX00 188 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PS29 197 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS47A8MTI9 375 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPN14A8MX76 684 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 B4E171 279 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXS1O43638 330 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PRAMEF10O60809 474 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFPL1O95159 310 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ADORA2AP29274 412 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CD6P30203 668 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKAR1BP31321 381 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 UQCRC1P31930 480 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TSPAN7P41732 249 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 NPTX2P47972 431 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TWNKQ96RR1 684 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX101Q9BY14 249 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR87Q9BY21 358 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF181Q9P0P0 153 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms