RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SLC38A8A6NNN8 435 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 KPNA7A9QM74 516 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 LILRB5O75023 590 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FAM163BP0C2L3 166 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 UCHL3P15374 230 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GABRR2P28476 465 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SOX9P48436 509 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 KLK7P49862 253 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TNNC1P63316 161 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 PPP2R5DQ14738 602 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 VEPH1Q14D04 833 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TAF12Q16514 161 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 MGAT5BQ3V5L5 792 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GPR158Q5T848 1215 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GAREM2Q75VX8 874 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ITIH5Q86UX2 942 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 METTL23Q86XA0 190 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FMNL3Q8IVF7 1028 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 PPM1KQ8N3J5 372 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TTC39CQ8N584 583 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TTC8Q8TAM2 541 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 NELL1Q92832 810 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 PSMG2Q969U7 264 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 JAKMIP2Q96AA8 810 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 LPIN3Q9BQK8 851 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 NIF3L1Q9GZT8 377 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 XYLT2Q9H1B5 865 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 EPC1Q9H2F5 836 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ASB3Q9Y575 518 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PQJ5 194 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ARNTLO00327 626 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CYB561D2O14569 222 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CHADO15335 359 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FGF19O95750 216 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TUFMP49411 452 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CCR3P51677 355 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 NRLP54845 237 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GCNT1Q02742 428 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FCHO2Q0JRZ9 810 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 LPAL2Q16609 132 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 DPH6Q7L8W6 267 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 THEM5Q8N1Q8 247 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GIPC2Q8TF65 315 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TATDN2Q93075 761 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ZFYVE19Q96K21 471 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SPAG5Q96R06 1193 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 MMS19Q96T76 1030 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 IER2Q9BTL4 223 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 STK33Q9BYT3 514 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 DNAI2Q9GZS0 605 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GANQ9H2C0 597 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CYP3A43Q9HB55 503 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SIX2Q9NPC8 291 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 78.9
UBE2B-208ENST00000511807 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GMEB2Q9UKD1 530 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 DSEQ9UL01 958 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 RAB23Q9ULC3 237 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CAPN11Q9UMQ6 739 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 HUS1O60921 280 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 NOL4O94818 638 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CYP11A1P05108 521 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CHRNB1P11230 501 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ATF6P18850 670 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CXCL12P48061 93 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ZBED6P86452 979 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CYP4F8P98187 520 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SATB1Q01826 763 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CUL2Q13617 745 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 RAPGEF1Q13905 1077 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC32Q14392 662 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 WSCD1Q658N2 575 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SPOPLQ6IQ16 392 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 PRR23BQ6ZRT6 265 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 RRAGAQ7L523 313 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF19Q8IW93 802 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 SPC24Q8NBT2 197 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CPLX3Q8WVH0 158 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms