RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC3	Q9BY71	257 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PPT2	Q9UMR5	302 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PTPRJ	Q12913	1337 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PASK	Q96RG2	1323 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR19	A6NJB7	356 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HAS3	O00219	553 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP2K7	O14733	419 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BUB1	O43683	1085 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRN2	O75325	713 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	IL18RAP	O95256	599 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	F2	P00734	622 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP3	P08254	477 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CLTA	P09496	248 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MYBL1	P10243	752 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MCF2	P10911	925 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFAIP3	P21580	790 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GPC5	P78333	572 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFAIP2	Q03169	654 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CUL2	Q13617	745 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS6KA1	Q15418	735 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CLUL1	Q15846	466 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX35	Q5T0J7	233 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GK5	Q6ZS86	529 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	REC114	Q7Z4M0	266 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZAR1	Q86SH2	424 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF149	Q8NC42	400 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	AFG1L	Q8WV93	481 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KAT5	Q92993	513 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CDT1	Q9H211	546 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	OGFR	Q9NZT2	677 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF185	O15231	689 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GSC2	O15499	205 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP26A1	O43174	497 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SRGAP2	O75044	1071 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ERLIN1	O75477	346 aa		5.91	□□□□□ -1.46

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