RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 FBXO32Q969P5 355 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 PRRX2Q99811 253 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa24.73■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 FAM170BA6NMN3 283 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 CCDC192P0DO97 292 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 NUBP1P53384 320 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 TNK2Q07912 1038 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 ZNF852Q6ZMS4 543 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 CLEC20AQ6ZU45 233 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 TTC39CQ8N584 583 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 DTWD2Q8NBA8 298 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 LMO3Q8TAP4 145 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 GKN1Q9NS71 199 aa24.72■■□□□ 1.55
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STRADB-209ENST00000488196 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 IL37Q9NZH6 218 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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STRADB-209ENST00000488196 TARSP26639 723 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 SOX9P48436 509 aa24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 PPP3CCP48454 512 aa24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 FAM122AQ96E09 287 aa24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 NT5C1BQ96P26 610 aa24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.71■■□□□ 1.55
STRADB-209ENST00000488196 RNF38Q9H0F5 515 aa24.71■■□□□ 1.55
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STRADB-209ENST00000488196 P4HA2O15460 535 aa24.7■■□□□ 1.54
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STRADB-209ENST00000488196 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 PTPN5P54829 565 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 PLCB2Q00722 1185 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 CETN1Q12798 172 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 UBR7Q8N806 425 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 KAT5Q92993 513 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 FAM83CQ9BQN1 747 aa24.7■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 GMIPQ9P107 970 aa24.7■■□□□ 1.54
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STRADB-209ENST00000488196 H0Y858 1186 aa24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.69■■□□□ 1.54
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STRADB-209ENST00000488196 PLA2G5P39877 138 aa24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 NHLH1Q02575 133 aa24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 ZNF77Q15935 545 aa24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 DUSP16Q9BY84 665 aa24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 MYO16Q9Y6X6 1858 aa24.68■■□□□ 1.54
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STRADB-209ENST00000488196 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 ZXDBP98169 803 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 USP4Q13107 963 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 MTF1Q14872 753 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 RRAGAQ7L523 313 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.68■■□□□ 1.54
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STRADB-209ENST00000488196 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 FAM3CQ92520 227 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 NELL2Q99435 816 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 EBF3Q9H4W6 596 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 HPS4Q9NQG7 708 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 COMMD8Q9NX08 183 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 FAM92AA1XBS5 289 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 ARSAP15289 507 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 PFKLP17858 780 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 PDE6CP51160 858 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 FZD5Q13467 585 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.67■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.66■■□□□ 1.54
STRADB-209ENST00000488196 OLFM2O95897 454 aa24.66■■□□□ 1.54
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