RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 F13A1P00488 732 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ABL1P00519 1130 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ADRB1P08588 477 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PFKLP17858 780 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 OPRD1P41143 372 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ME1P48163 572 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SEC13P55735 322 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC7A9P82251 487 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF10Q12962 218 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 NR1H3Q13133 447 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPC3Q13507 836 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 RESP18Q5W5W9 173 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 C12orf56Q8IXR9 622 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 EHD2Q9NZN4 543 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP205Q92621 2012 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 MYH10P35580 1976 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 DCLK1O15075 740 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 EXOC3O60645 756 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP17A1P05093 508 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PKP1Q13835 747 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PLK5Q496M5 336 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SNX21Q969T3 373 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.01■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 K7EQS6 105 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PHACTR2O75167 634 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM163BP0C2L3 166 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF806P0C7X5 589 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNA4P22459 653 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ATICP31939 592 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 MPLP40238 635 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP3CCP48454 512 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 CDH8P55286 799 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF699Q32M78 642 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 C2orf27AQ580R0 203 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PLA2G2CQ5R387 149 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 USP33Q8TEY7 942 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SLITRK1Q96PX8 696 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 CFAP97Q9P2B7 532 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 EBF1Q9UH73 591 aa18■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 THADAQ6YHU6 1953 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 KLRC4O43908 158 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 CLSTN1O94985 981 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 DGKEP52429 567 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 LIMK1P53667 647 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 MESP2Q0VG99 397 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 BIRC3Q13489 604 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 TCEAL6Q6IPX3 200 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM35AQ86V20 835 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SFTPA1Q8IWL2 248 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA0895Q8NCT3 520 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 TCEAL3Q969E4 200 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 TPSD1Q9BZJ3 242 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 VRTNQ9H8Y1 702 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SERTAD1Q9UHV2 236 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa17.99■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 VNN1O95497 513 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 YWHAQP27348 245 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 STK4Q13043 487 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 NCOA4Q13772 614 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 DHCR24Q15392 516 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ELF2Q15723 593 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 IL31Q6EBC2 164 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 C12orf40Q86WS4 652 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 HSCBQ8IWL3 235 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP57L1Q8IYX8 460 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP93Q8N1F7 819 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SCAMP5Q8TAC9 235 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 PARD3BQ8TEW8 1205 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO32Q969P5 355 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNK16Q96T55 309 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SDCBP2Q9H190 292 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 INVSQ9Y283 1065 aa17.98■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.97■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC6A11P48066 632 aa17.97■□□□□ 0.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC5A3P53794 718 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms