RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483532.1

TUBGCP3-206, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 3, human

TSL 5

Gene TUBGCP3, Length 712 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP3-206	ENST00000483532	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PGBD3	Q8N328	593 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	GATA6	Q92908	595 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PNKP	Q96T60	521 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	KAT7	O95251	611 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	APOD	P05090	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CYP17A1	P05093	508 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ENG	P17813	658 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PDC	P20941	246 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	GART	P22102	1010 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	LMO2	P25791	158 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PTGER3	P43115	390 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SLC6A11	P48066	632 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PPP3CC	P48454	512 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	DHCR24	Q15392	516 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	E2F4	Q16254	413 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	EOGT	Q5NDL2	527 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SGK1	O00141	431 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CFI	P05156	583 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	TXLNA	P40222	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	DPP6	P42658	865 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	USP46	P62068	366 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SLC7A9	P82251	487 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PI4KA	P42356	2102 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PTPRD	P23468	1912 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	TRIM66	O15016	1216 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	STX6	O43752	255 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ABCB7	O75027	752 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	ADH1C	P00326	375 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP3-206	ENST00000483532	TNNC2	P02585	160 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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