RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478370.5

IFT80-215, Transcript of intraflagellar transport 80, humanhuman

TSL 4

Gene IFT80, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT80-215ENST00000478370 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TNIP3Q96KP6 325 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 BCO2Q9BYV7 579 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 COMMD8Q9NX08 183 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 RAB20Q9NX57 234 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 EHD2Q9NZN4 543 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 THEGQ9P2T0 379 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CDH9Q9ULB4 789 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CACNA1BQ00975 2339 aa6.89□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CLUHO75153 1309 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 PTPRJQ12913 1337 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TGM5O43548 720 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 XYLBO75191 536 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TPM2P07951 284 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 FAM157BP0CG42 384 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CD33P20138 364 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 ELF1P32519 619 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MAGEA11P43364 429 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MAPK8P45983 427 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 FMO5P49326 533 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MXI1P50539 228 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MYL6P60660 151 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TNNC1P63316 161 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 DLG4P78352 724 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TSPY1Q01534 308 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 GCNT1Q02742 428 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 PPP3CAQ08209 521 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 INCA1Q0VD86 236 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 BIRC3Q13489 604 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MAN2A1Q16706 1144 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 ZNF699Q32M78 642 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 ISM2Q6H9L7 571 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 VSTM1Q6UX27 236 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 GPR149Q86SP6 731 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 SUSD6Q92537 303 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 NXPE3Q969Y0 559 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CITED4Q96RK1 184 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MED15Q96RN5 788 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 GPR88Q9GZN0 384 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 S1PR5Q9H228 398 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CLDND1Q9NY35 253 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CLEC1BQ9P126 229 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CD207Q9UJ71 328 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.88□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 C5orf42Q9H799 3197 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 REV3LO60673 3130 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 F8W810 466 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 ZNF197O14709 1029 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 VNN1O95497 513 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 HLA-DRAP01903 254 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 PTPN2P17706 415 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 PFKLP17858 780 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 PPP3CCP48454 512 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 GCLMP48507 274 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 ROR1Q01973 937 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MYL5Q02045 173 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 STILQ15468 1287 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 MEA1Q16626 185 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 LIN9Q5TKA1 542 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT80-215ENST00000478370 WSCD1Q658N2 575 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms