RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 HDCP19113 662 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TARSP26639 723 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 NHLH1Q02575 133 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TNK2Q07912 1038 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM59Q8IWR1 403 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 JAKMIP2Q96AA8 810 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 MED15Q96RN5 788 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 GKN1Q9NS71 199 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 GTSE1Q9NYZ3 720 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 MYO16Q9Y6X6 1858 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SOX9P48436 509 aa31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 CUL2Q13617 745 aa31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TTC39CQ8N584 583 aa31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 MLKLQ8NB16 471 aa31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SLC4A11Q8NBS3 891 aa31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 DNAI2Q9GZS0 605 aa31.02■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 F5P12259 2224 aa31.01■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 RAD23BP54727 409 aa31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PLCB2Q00722 1185 aa31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CLEC20AQ6ZU45 233 aa31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM176AQ96HP8 235 aa31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 MAN2B1O00754 1011 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC192P0DO97 292 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PPP3CCP48454 512 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 MARSP56192 900 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 KCNH2Q12809 1159 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM68Q6AZZ1 485 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CREBRFQ8IUR6 639 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 FAM3CQ92520 227 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 FAM86C1Q9NVL1 165 aa31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PMM2O15305 246 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF77Q15935 545 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 DPCR1Q3MIW9 517 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 SH3RF2Q8TEC5 729 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 NT5C1BQ96P26 610 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 OSBPL6Q9BZF3 934 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 RNF38Q9H0F5 515 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 IL37Q9NZH6 218 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 GMIPQ9P107 970 aa30.99■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 AFPP02771 609 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PDE6CP51160 858 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CETN1Q12798 172 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 USP4Q13107 963 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 MTF1Q14872 753 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PDZD8Q8NEN9 1154 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 GPT2Q8TD30 523 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 NELL2Q99435 816 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 FAM83CQ9BQN1 747 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 EBF3Q9H4W6 596 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa30.98■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 HHLA1C9JL84 531 aa30.97■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 LMO3Q8TAP4 145 aa30.97■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 OVCA2Q8WZ82 227 aa30.97■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 HPS4Q9NQG7 708 aa30.97■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 COMMD8Q9NX08 183 aa30.97■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 P4HA2O15460 535 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 OAS1P00973 400 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 ARSAP15289 507 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PFKLP17858 780 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 ZXDBP98169 803 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 ANGPT1Q15389 498 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 TXNDC11Q6PKC3 985 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PPM1KQ8N3J5 372 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 KAT5Q92993 513 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PHOX2BQ99453 314 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 DUSP16Q9BY84 665 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 SMPD4Q9NXE4 827 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 WNT6Q9Y6F9 365 aa30.96■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 FAM92AA1XBS5 289 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CTHP32929 405 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 PGFP49763 221 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 FZD5Q13467 585 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 RUNX3Q13761 415 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 UBR7Q8N806 425 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 FBXO44Q9H4M3 255 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CPQQ9Y646 472 aa30.95■■■□□ 2.55
FBXO18-208ENST00000470089 CACNA1HO95180 2353 aa30.94■■■□□ 2.54
FBXO18-208ENST00000470089 GOLGA6L22H0YM25 854 aa30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms