RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CISHQ9NSE2 258 aa25.41■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.41■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 MIA3Q5JRA6 1907 aa25.41■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.41■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 COL4A2P08572 1712 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 GNA14O95837 355 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 FAM200BP0CF97 657 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 SLC5A3P53794 718 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 MAP3K7CLP57077 242 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 TNK2Q07912 1038 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 ANGPT1Q15389 498 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 ZMIZ2Q8NF64 920 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 FAM86C1Q9NVL1 165 aa25.4■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 TNFRSF10BO14763 440 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 BEST1O76090 585 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 PFKLP17858 780 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 SOX9P48436 509 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 LRMPQ12912 555 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 RIN3Q8TB24 985 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 MSANTD3Q96H12 275 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa25.39■■□□□ 1.66
SMKR1-201ENST00000462322 PIEZO1Q92508 2521 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 MYH10P35580 1976 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CUL2Q13617 745 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 MTF1Q14872 753 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN23Q96B33 292 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 COMMD8Q9NX08 183 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.38■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEA9P43362 315 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CETN1Q12798 172 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF77Q15935 545 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM68Q6AZZ1 485 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM176AQ96HP8 235 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 EBF3Q9H4W6 596 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 IL37Q9NZH6 218 aa25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 PMM2O15305 246 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC192P0DO97 292 aa25.36■■□□□ 1.65
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SMKR1-201ENST00000462322 RAD23BP54727 409 aa25.36■■□□□ 1.65
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SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 MLKLQ8NB16 471 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 SLC4A11Q8NBS3 891 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 GBP4Q96PP9 640 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 PHOX2BQ99453 314 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 RNF38Q9H0F5 515 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.36■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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SMKR1-201ENST00000462322 RUNX3Q13761 415 aa25.35■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF687Q8N1G0 1237 aa25.35■■□□□ 1.65
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SMKR1-201ENST00000462322 ARSAP15289 507 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 TCF3P15923 654 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 IFNAR2P48551 515 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 KCNH2Q12809 1159 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 TXNDC11Q6PKC3 985 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP16Q9BY84 665 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 LMAN1LQ9HAT1 526 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 SMPD4Q9NXE4 827 aa25.34■■□□□ 1.65
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