RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451156.1

TRPS1-205, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRPS1, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-205ENST00000451156 TATDN2Q93075 761 aa22.99■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.99■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.99■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 PHOX2BQ99453 314 aa22.99■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SMOQ99835 787 aa22.99■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.99■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 TCF3P15923 654 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CD58P19256 250 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 TNK2Q07912 1038 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CAMK4Q16566 473 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 RIN3Q8TB24 985 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 KRT82Q9NSB4 513 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 OBSL1O75147 1896 aa22.98■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 COL4A2P08572 1712 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 FAM92AA1XBS5 289 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 PROB1E7EW31 1015 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 BEST1O76090 585 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 PAK1Q13153 545 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 ZNF77Q15935 545 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CISHQ9NSE2 258 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.97■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 GNA14O95837 355 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 OLFM2O95897 454 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 FAM200BP0CF97 657 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CTHP32929 405 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 NBL1P41271 181 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SOX9P48436 509 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 FMO5P49326 533 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 MRE11P49959 708 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SLC5A3P53794 718 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 MAP3K7CLP57077 242 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 SLC7A9P82251 487 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 RUNX3Q13761 415 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 MTF1Q14872 753 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 PDGFRLQ15198 375 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 TTC8Q8TAM2 541 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 RNF38Q9H0F5 515 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 HPS4Q9NQG7 708 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-205ENST00000451156 ABL1P00519 1130 aa22.95■■□□□ 1.26
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TRPS1-205ENST00000451156 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 FBXO32Q969P5 355 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 EBF3Q9H4W6 596 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 ADORA2BP29275 332 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 RAD23BP54727 409 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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TRPS1-205ENST00000451156 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 ZNF394Q53GI3 561 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 ARID3AQ99856 593 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 CHRDQ9H2X0 955 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 HHLA1C9JL84 531 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 P4HA2O15460 535 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 LAMTOR5O43504 91 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 CUL2Q13617 745 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 IER2Q9BTL4 223 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 DUSP16Q9BY84 665 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-205ENST00000451156 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.93■■□□□ 1.26
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