RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
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PRAME-210ENST00000442481 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12.45□□□□□ -0.42
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PRAME-210ENST00000442481 LPCAT2Q7L5N7 544 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-210ENST00000442481 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-210ENST00000442481 WASF3Q9UPY6 502 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 OBSL1O75147 1896 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-210ENST00000442481 MAP3K13O43283 966 aa12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-210ENST00000442481 HDCP19113 662 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 ANXA13P27216 316 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 HOXD12P35452 270 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 CYP24A1Q07973 514 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 MYO1EQ12965 1108 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 ANO7Q6IWH7 933 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 VSTM1Q6UX27 236 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-210ENST00000442481 RASSF3Q86WH2 238 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 WDR49Q8IV35 697 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 PDCL2Q8N4E4 241 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-210ENST00000442481 OR5B17Q8NGF7 314 aa12.43□□□□□ -0.42
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