RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CEP72Q9P209 647 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 MYO6Q9UM54 1294 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ADAMTS3O15072 1205 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 DTNBO60941 627 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PHACTR2O75167 634 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 C6P13671 934 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PFKFB1P16118 471 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GNA11P29992 359 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC8A1P32418 973 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SYKP43405 635 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GALK1P51570 392 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RCAN1P53805 252 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EPHB3P54753 998 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PTENP60484 403 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GNGT1P63211 74 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RHDQ02161 417 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CYP4A11Q02928 519 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ADCY2Q08462 1091 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TFDP1Q14186 410 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EMC2Q15006 297 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC39A14Q15043 492 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GLRX5Q86SX6 157 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RASSF3Q86WH2 238 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PGBD3Q8N328 593 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35F6Q8N357 371 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 WHAMMQ8TF30 809 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RLN3Q8WXF3 142 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CD101Q93033 1021 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM143Q96AN5 459 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 WBP1Q96G27 269 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FAM210AQ96ND0 272 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PNMA5Q96PV4 448 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GCNAQ96QF7 691 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SH3GL3Q99963 347 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EBF3Q9H4W6 596 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CAPN10Q9HC96 672 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GKN1Q9NS71 199 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TSC2P49815 1807 aa6.9□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.9□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 A0A1B0GTH6 734 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FAM149AA5PLN7 773 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 I3L4J1 428 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 BIN1O00499 593 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ZBTB43O43298 467 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 EDIL3O43854 480 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 NEBLO76041 1014 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FGF19O95750 216 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CPB1P15086 417 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GGCXP38435 758 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PBX1P40424 430 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 P2RY2P41231 377 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 BRCC3P46736 316 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 USP11P51784 963 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 NPEPPSP55786 919 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SEMG2Q02383 582 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 APBA1Q02410 837 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 POU5F1BQ06416 359 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 NNTQ13423 1086 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SLMAPQ14BN4 828 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 AMHR2Q16671 573 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 Q4G0T1 1027 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC157Q569K6 752 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.89□□□□□ -1.31
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