RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438413.5

MUC1-211, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-211ENST00000438413 HOXD13P35453 343 aa20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 SLC6A11P48066 632 aa20.38■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 TAF10Q12962 218 aa20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 ALLCQ8N6M5 410 aa20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 RDH13Q8NBN7 331 aa20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.38■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.38■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 ALDH1A2O94788 518 aa20.37■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.37■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 CYP24A1Q07973 514 aa20.34■□□□□ 0.85
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MUC1-211ENST00000438413 TRPC3Q13507 836 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 EOGTQ5NDL2 527 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 EMC10Q5UCC4 262 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 NUP93Q8N1F7 819 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 RLN3Q8WXF3 142 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
MUC1-211ENST00000438413 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
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