RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 KLRC1P26715 233 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 PRKAR1BP31321 381 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 FMO1Q01740 532 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 CHSY1Q86X52 802 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 TERB1Q8NA31 727 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 APIPQ96GX9 242 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 AP4M1O00189 453 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 PSMD9O00233 223 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZBED1O96006 694 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 E2F1Q01094 437 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ASB2Q96Q27 587 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 SNX18Q96RF0 628 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 PRR25Q96S07 402 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 WDR91A4D1P6 747 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 VSTM5A8MXK1 200 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 GOLIM4O00461 696 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 TPP1O14773 563 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 EXOC3O60645 756 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 RASSF9O75901 435 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 TUBB4AP04350 444 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 PRR35P0CG20 571 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 CYP2D6P10635 497 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 GKP32189 559 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 GBX1Q14549 363 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 NPY5RQ15761 445 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 MTX3Q5HYI7 312 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 COL20A1Q9P218 1284 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 AMFRQ9UKV5 643 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 USP22Q9UPT9 525 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 PPP6CO00743 305 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ADAMTS3O15072 1205 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 SRGAP2O75044 1071 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 PMPCBO75439 489 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 RASAL1O95294 804 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 KELP23276 732 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 EPHA3P29320 983 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 EPHB2P29323 1055 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 MPGP29372 298 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 UQCRC1P31930 480 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF81P51508 661 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 FAM193AP78312 1265 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ARHGEF7Q14155 803 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 GRM3Q14832 879 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 CEP78Q5JTW2 689 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 FCRL6Q6DN72 434 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 NEK8Q86SG6 692 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF778Q96MU6 729 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 STK31Q9BXU1 1019 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 CIPCQ9C0C6 399 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 RNF7Q9UBF6 113 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-204ENST00000422939 H7C4K7 107 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RGS10O43665 173 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 MGEA5O60502 916 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms