RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUL4AQ13619 759 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHCR24Q15392 516 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC30AQ86WT1 665 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf48Q96LL4 319 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNMDQ9H2S6 317 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TACC1O75410 805 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAT7O95251 611 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABL1P00519 1130 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA2D1P54289 1103 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXC1Q12948 553 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF10Q12962 218 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf40Q86WS4 652 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALLCQ8N6M5 410 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDILTQ8N807 584 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WHAMMQ8TF30 809 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPS3Q969F9 1004 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPACA7Q96KW9 195 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP28Q96RU2 1077 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNKPQ96T60 521 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX25Q9H3E2 840 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.03□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGK1O00141 431 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADH1CP00326 375 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APODP05090 189 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QTNF9P0C862 333 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEACAM1P13688 526 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT1P21579 422 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXD13P35453 343 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIE1P35590 1138 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RY2P41231 377 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A11P48066 632 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNC1P63316 161 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MESP2Q0VG99 397 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A14Q15043 492 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGKQ92643 395 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CGRRF1Q99675 332 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.02□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM163BP0C2L3 166 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADH5P11766 374 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNI1P19237 187 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRX4P78413 519 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDSRQ06136 332 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EOGTQ5NDL2 527 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RLN3Q8WXF3 142 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNBP1Q96RU3 617 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM9Q9C026 710 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASF3Q9UPY6 502 aa14.01□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MXQ7 604 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF10BO14763 440 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms