RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NT5C1BQ96P26 610 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MMS19Q96T76 1030 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MACROD1Q9BQ69 325 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CIPCQ9C0C6 399 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AMFRQ9UKV5 643 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TPCN1Q9ULQ1 816 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDY1Q9Y6F8 540 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM43BA6NCK2 446 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BTBD19C9JJ37 291 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM232C9JQI7 657 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADAMTS3O15072 1205 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GCATO75600 419 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RASSF9O75901 435 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 INMTO95050 263 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PDE8BO95263 885 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RASAL1O95294 804 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BMP15O95972 392 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MPGP29372 298 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GKP32189 559 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MMP13P45452 471 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RENBPP51606 427 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ETFDHQ16134 617 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CYP1B1Q16678 543 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PLEKHG6Q3KR16 790 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CEP78Q5JTW2 689 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FCRL6Q6DN72 434 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF425Q6IV72 752 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GLCCI1Q86VQ1 547 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CNGA4Q8IV77 575 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TCEAL8Q8IYN2 117 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CHPFQ8IZ52 775 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C8orf58Q8NAV2 365 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DNAJB14Q8TBM8 379 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C5orf34Q96MH7 638 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRR25Q96S07 402 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C17orf80Q9BSJ5 609 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VN1R3Q9BXE9 311 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C22orf23Q9BZE7 217 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRRC27Q9C0I9 530 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRSS22Q9GZN4 317 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BHMT2Q9H2M3 363 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SMURF2Q9HAU4 748 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM36Q9NQ86 728 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OGDHLQ9ULD0 1010 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 USP22Q9UPT9 525 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GOLGA6CA6NDK9 693 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GOLGA6BA6NDN3 693 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AQP7P3A6NL99 342 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM233B4DJY2 109 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AP4M1O00189 453 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CES2O00748 559 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RGS10O43665 173 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMPRSS11DO60235 418 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MGEA5O60502 916 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIAS2O75928 621 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VNN1O95497 513 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GOLGA6DP0CG33 693 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MYBP10242 640 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FPR3P25089 353 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARHGAP25P42331 645 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM187BQ17R55 369 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LY6KQ17RY6 165 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PXDC1Q5TGL8 231 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 APOA5Q6Q788 366 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTCHD4Q6ZW05 846 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 YAF2Q8IY57 180 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAGEB6Q8N7X4 407 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR56A3Q8NH54 315 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms