RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCAMP5Q8TAC9 235 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 MSANTD3Q96H12 275 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NELL2Q99435 816 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NT5C1AQ9BXI3 368 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF38Q9H0F5 515 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM49BQ9NUQ9 324 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 GTSE1Q9NYZ3 720 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM170BA6NMN3 283 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PROB1E7EW31 1015 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 AP1G2O75843 785 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP17L7P0C7H9 530 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CTHP32929 405 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBL1P41271 181 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SOX9P48436 509 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP3CCP48454 512 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAD23BP54727 409 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PAK1Q13153 545 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBXN2BQ14CS0 331 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF852Q6ZMS4 543 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC4A11Q8NBS3 891 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 OVCA2Q8WZ82 227 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CISHQ9NSE2 258 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM86C1Q9NVL1 165 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 COMMD8Q9NX08 183 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATG2BQ96BY7 2078 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM186AA6NE01 2351 aa17.31■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP8B3O60423 1300 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 BICDL2A1A5D9 508 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAN2B1O00754 1011 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 DPYSL4O14531 572 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHRNB1P11230 501 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD58P19256 250 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 YWHAQP27348 245 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAGEA9P43362 315 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 STX17P56962 302 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCERG1LQ5VWI1 586 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAMSTRQ6ZN01 415 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 YAF2Q8IY57 180 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 GKN1Q9NS71 199 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 EHD2Q9NZN4 543 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa17.3■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 STK25O00506 426 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TDGF1P13385 188 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 HDCP19113 662 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACO1P21399 889 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CUL2Q13617 745 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 GAS6Q14393 721 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTF1Q14872 753 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGAP17Q68EM7 881 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 C1orf210Q8IVY1 113 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTC39CQ8N584 583 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA1958Q8N8K9 716 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM3CQ92520 227 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NELL1Q92832 810 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 MED10Q9BTT4 135 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHRDQ9H2X0 955 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRPC7Q9HCX4 862 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa17.29■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 P4HA2O15460 535 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CKMP06732 381 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM200BP0CF97 657 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARSAP15289 507 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADORA2BP29275 332 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TUBP50607 506 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K7CLP57077 242 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RUNX3Q13761 415 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 GAB4Q2WGN9 574 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 EML3Q32P44 896 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC150Q8NCX0 1101 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SH3RF2Q8TEC5 729 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 OSCP1Q8WVF1 389 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXO32Q969P5 355 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.28■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms