RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390484.1

TRAJ54-201, Transcript of T cell receptor alpha joining 54, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAJ54, Length 60 nt, Biotype TR J gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAJ54-201ENST00000390484 CYP4F8P98187 520 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CDC42EP1Q00587 391 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 NDPQ00604 133 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 B4GALNT1Q00973 533 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 E2F1Q01094 437 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 IL9RQ01113 521 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MC2RQ01718 297 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 FMO1Q01740 532 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC6A3Q01959 620 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ROR1Q01973 937 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RHAGQ02094 409 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RHDQ02161 417 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 APBA1Q02410 837 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 NHLH2Q02577 135 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GCNT1Q02742 428 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CYP4A11Q02928 519 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CFHR3Q02985 330 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GSTM4Q03013 218 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MECOMQ03112 1051 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PPARDQ03181 441 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TAP2Q03519 686 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CHRNEQ04844 493 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RELQ04864 619 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GRIN1Q05586 938 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC18A2Q05940 514 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 FAM160A1Q05DH4 1040 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 LTBQ06643 244 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PAX8Q06710 450 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF33BQ06732 778 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 FMODQ06828 376 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CHRNDQ07001 517 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TNFRSF9Q07011 255 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PDE4BQ07343 736 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MCL1Q07820 350 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC20A2Q08357 652 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GOLGA2Q08379 1002 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ADCY2Q08462 1091 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PDE4CQ08493 712 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CD300CQ08708 224 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ADCY1Q08828 1119 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 FAM27E3Q08E93 113 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF543Q08ER8 600 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF763Q0D2J5 394 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 FCHO2Q0JRZ9 810 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 C17orf67Q0P5P2 114 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 KIAA2012Q0VF49 1180 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 USP17L24Q0WX57 530 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MGAT2Q10469 447 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SCRN1Q12765 414 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TROAPQ12815 778 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 COX10Q12887 443 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 LMAN2Q12907 356 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DLG1Q12959 904 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PTP4A2Q12974 167 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 COASYQ13057 564 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 LCP2Q13094 533 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZBTB17Q13105 803 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RESTQ13127 1097 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CALCOCO2Q13137 446 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PAK2Q13177 524 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SEMA3BQ13214 749 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GPS2Q13227 327 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GRM1Q13255 1194 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC14A1Q13336 389 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SP140Q13342 867 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ITGADQ13349 1161 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CTBP1Q13363 440 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MPP3Q13368 585 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 IKZF1Q13422 519 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 LSAMPQ13449 338 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MADCAM1Q13477 382 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MTM1Q13496 603 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MTX1Q13505 466 aa-0.06□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 OLIG2Q13516 323 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms