RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 SNX31Q8N9S9 440 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 URGCPQ8TCY9 931 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TK2O00142 265 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MTFR1Q15390 333 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 USP49Q70CQ1 688 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SPATA33Q96N06 139 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SAR1AQ9NR31 198 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KLHL3Q9UH77 587 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GALNTL6Q49A17 601 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SPON2Q9BUD6 331 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MBD2Q9UBB5 411 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GRAP2O75791 330 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 BGNP21810 368 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PTPN7P35236 360 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RAD51Q06609 339 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GPD1P21695 349 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CRKP46108 304 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RAD23AP54725 363 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NCKAP1LP55160 1127 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NCALDP61601 193 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TTLL4Q14679 1199 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CNGA2Q16280 664 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SYTL3Q4VX76 610 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 HEATR9A2RTY3 570 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 COX10Q12887 443 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ENKURQ8TC29 256 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 OLFM1Q99784 485 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 USP21Q9UK80 565 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PEX1O43933 1283 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PRIM2P49643 509 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SVOPQ8N4V2 548 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 APOL5Q9BWW9 433 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FASP25445 335 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ELMOD1Q8N336 334 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 IL18RAPO95256 599 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ACADSBP45954 432 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RHOBTB1O94844 696 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SUPT7LO94864 414 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SLC16A1P53985 500 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TRAF2Q12933 501 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 IPMKQ8NFU5 416 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MEI4A8MW99 385 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RAD17O75943 681 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 AKT1P31749 480 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TWF1Q12792 350 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 HLFQ16534 295 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RNF146Q9NTX7 359 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ANXA9O76027 345 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PSMA3P25788 255 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RGS21Q2M5E4 152 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 COMMD8Q9NX08 183 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GRIK1P39086 918 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SLC1A6P48664 564 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ACCSLQ4AC99 568 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RDM1Q8NG50 284 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PIPSLA2A3N6 862 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-204ENST00000373190 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-204ENST00000373190 AVPR1AP37288 418 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-204ENST00000373190 RGS7P49802 495 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-204ENST00000373190 RNF149Q8NC42 400 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-204ENST00000373190 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-204ENST00000373190 IPPQ9Y573 584 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-204ENST00000373190 EXTL3O43909 919 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms