RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-204ENST00000373166 USP33Q8TEY7 942 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 L1RE1Q9UN81 338 aa20.48■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP24A1Q07973 514 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-204ENST00000373166 SPATA18Q8TC71 538 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PKMYT1Q99640 499 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 C2orf78A6NCI8 922 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALDH1A2O94788 518 aa20.45■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM84AQ96KN4 292 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 CGRRF1Q99675 332 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.45■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.44■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.44■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.44■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.44■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K13O43283 966 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MAGEA11P43364 429 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 DEFB124Q8NES8 71 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 CXorf38Q8TB03 319 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC32A1Q9H598 525 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATRXP46100 2492 aa20.42■□□□□ 0.86
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