RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 FGAP02671 866 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PHKG2P15735 406 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 AKAP5P24588 427 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 SLC11A2P49281 568 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 THBS3P49746 956 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 UCP3P55916 312 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC157Q569K6 752 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MVB12AQ96EY5 273 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC17Q96LX7 622 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CECR2Q9BXF3 1484 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MROH2BQ7Z745 1585 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 GCATO75600 419 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 KCNA3P22001 575 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PSG6Q00889 435 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 AMPD3Q01432 767 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 KRT17Q04695 432 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LY6KQ17RY6 165 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 A0A087WWL8 130 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CD8B2A6NJW9 211 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 M0R3H8 397 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MYO1CO00159 1063 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 TLR2O60603 784 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MT-CO3P00414 261 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 GKP32189 559 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 THBS4P35443 961 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MAP4K1Q92918 833 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LYZL4Q96KX0 146 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PMPCBO75439 489 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 RNF8O76064 485 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 VNN1O95497 513 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 IL33O95760 270 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 TOMM40O96008 361 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 VCAM1P19320 739 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 NACADO15069 1562 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 WIZO95785 1651 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PSMD9O00233 223 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ALPLP05186 524 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ID2Q02363 134 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CFHR1Q03591 330 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LMAN2Q12907 356 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ANO7Q6IWH7 933 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 HPS3Q969F9 1004 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 POT1Q9NUX5 634 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 CES2O00748 559 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ALDH2P05091 517 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ARFIP2P53365 341 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PRKAG1P54619 331 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 EVA1CP58658 441 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF91Q05481 1191 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 ERV3-1Q14264 604 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 MLC1Q15049 377 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LCE1EQ5T753 118 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms