RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACVR2AP27037 513 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKAR1BP31321 381 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGA8P53708 1063 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCAT1P54687 386 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP4F2P78329 520 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF7Q14155 803 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC29A2Q14542 456 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 YAF2Q8IY57 180 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOL5Q9BWW9 433 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MID2Q9UJV3 735 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCSK5Q92824 1860 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 AOX1Q06278 1338 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMD9O00233 223 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIAS2O75928 621 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TJP3O95049 919 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 INMTO95050 263 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKCGP05129 697 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPH1P17752 444 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHA3P29320 983 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPT1AP50416 773 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 E2F1Q01094 437 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP1B1Q16678 543 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT78Q8N1N4 520 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2W1Q8TAV3 490 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 REPS1Q96D71 796 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR25Q96S07 402 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM5Q9C035 493 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHST8Q9H2A9 424 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 WIPF3A6NGB9 483 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 AQP7P3A6NL99 342 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 F8W8V4 182 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM22K7EJ46 135 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP4M1O00189 453 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE8BO95263 885 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL1R2P27930 398 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 UQCRC1P31930 480 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 GKP32189 559 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK3Q13188 491 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 COLEC12Q5KU26 742 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCRL6Q6DN72 434 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNC13DQ70J99 1090 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPF1Q92782 380 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX22Q96L94 193 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 C8orf48Q96LL4 319 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP22Q9UPT9 525 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF3BO15066 747 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC3O60645 756 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL18RAPO95256 599 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT-ND5P03915 603 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HGFP14210 728 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FPR3P25089 353 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGDP52209 483 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFF2Q03403 129 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRM1Q13255 1194 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms