RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361439.8

NSMCE1-201, Transcript of NSE1 homolog, SMC5-SMC6 complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NSMCE1, Length 1,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1-201ENST00000361439 PIGZQ86VD9 579 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TMC8Q8IU68 726 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 GIPC2Q8TF65 315 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CORO1BQ9BR76 489 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 MIS12Q9H081 205 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ACP6Q9NPH0 428 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 25.1
NSMCE1-201ENST00000361439 USTQ9Y2C2 406 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 USP3Q9Y6I4 520 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 EYSQ5T1H1 3165 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 FBXO21O94952 628 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ADCY5O95622 1261 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PSEN1P49768 467 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CDR1P51861 262 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 TMC6Q7Z403 805 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 TMEM110Q86TL2 294 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 UBA3Q8TBC4 463 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GCNAQ96QF7 691 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GDE1Q9NZC3 331 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SCML2Q9UQR0 700 aa14.58□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MFAP3LO75121 409 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 F11P03951 625 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SERPING1P05155 500 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 FSHRP23945 695 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 WEE1P30291 646 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MRE11P49959 708 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 FMO1Q01740 532 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ARID5AQ03989 594 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CLUL1Q15846 466 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PMF1Q6P1K2 205 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 VPS36Q86VN1 386 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MON1AQ86VX9 555 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GPR152Q8TDT2 470 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 IRGQQ8WZA9 623 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 AGPAT1Q99943 283 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SYT11Q9BT88 431 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 APOL5Q9BWW9 433 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 IL21Q9HBE4 155 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 NR2E1Q9Y466 385 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 COL6A3P12111 3177 aa14.57□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ZBED1O96006 694 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CALCAP01258 141 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MMEP08473 750 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GZMAP12544 262 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CHRNB2P17787 502 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GABRR2P28476 465 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 TUBP50607 506 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 TKTL1P51854 596 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 USP46P62068 366 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 CDK17Q00537 523 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 PDCLQ13371 301 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 MTMR3Q13615 1198 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 GAREM2Q75VX8 874 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 ZNF276Q8N554 614 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 STKLD1Q8NE28 680 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.56□□□□□ -0.08
NSMCE1-201ENST00000361439 FBXO32Q969P5 355 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms