RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PCED1BQ96HM7 432 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CHST7Q9NS84 486 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DPYSL4O14531 572 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM200BP0CF97 657 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KRT10P13645 584 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SCNN1AP37088 669 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DSC1Q08554 894 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KAZNQ674X7 775 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SEPT8Q92599 483 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CAVIN3Q969G5 261 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SUSD3Q96L08 255 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ACBD6Q9BR61 282 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 F8W810 466 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 B4GALT3O60512 393 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TJP3O95049 919 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SDC4P31431 198 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PTPN7P35236 360 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CDKN2BP42772 138 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ADCY2Q08462 1091 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SNX1Q13596 522 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DUPD1Q68J44 220 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DCLK3Q9C098 648 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DPH5Q9H2P9 285 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KRT82Q9NSB4 513 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM153BP0C7A2 387 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ECHS1P30084 290 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K7CLP57077 242 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ATP11AP98196 1134 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CCNG2Q16589 344 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CDO1Q16878 200 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM153CQ494X1 144 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ARCQ7LC44 396 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 APBB2Q92870 758 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DESP17661 470 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KDELR1P24390 212 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ADIGQ0VDE8 80 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 NNTQ13423 1086 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RAB6CQ53S08 254 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM35AQ86V20 835 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KRT222Q8N1A0 295 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SLCO2A1Q92959 643 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 HIPK3Q9H422 1215 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 AP1G2O75843 785 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ECEL1O95672 775 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 OR1G1P47890 313 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM171BQ6P995 826 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KCTD6Q8NC69 237 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SCLYQ96I15 445 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PEBP4Q96S96 227 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PRPSAP2O60256 369 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TYMPP19971 482 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FAAP100Q0VG06 881 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ABI1Q8IZP0 508 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ATL2Q8NHH9 583 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms