RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304101.8

KCNS3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-201ENST00000304101 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.51■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.51■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.51■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 SGK1O00141 431 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 RNF8O76064 485 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 ETS1P14921 441 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 NDST1P52848 882 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 IFT88Q13099 833 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 STAT4Q14765 748 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 MORF4L2Q15014 288 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 DPH6Q7L8W6 267 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 KIF12Q96FN5 646 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CDH16O75309 829 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 NPTXRO95502 500 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 ABHD2P08910 425 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 KDELR1P24390 212 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 GRM5P41594 1212 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 DYNLT1P63172 113 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 MTFR1Q15390 333 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TAZQ16635 292 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 BBS12Q6ZW61 710 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CABS1Q96KC9 395 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.5■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CST8O60676 142 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 LIG3P49916 1009 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 NKX3-2P78367 333 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 MYO1EQ12965 1108 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 ACTL9Q8TC94 416 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 IFNB1P01574 187 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 ITGA7Q13683 1181 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 UBA3Q8TBC4 463 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.49■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 MIPP30301 263 aa21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 KCTD6Q8NC69 237 aa21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TTC25Q96NG3 672 aa21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 APOL6Q9BWW8 343 aa21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 MIS12Q9H081 205 aa21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.48■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 USP18Q9UMW8 372 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TMEM120BA0PK00 339 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 THPOP40225 353 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 ARHGEF6Q15052 776 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CD48P09326 243 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PCK1P35558 622 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 STILQ15468 1287 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 SNTG2Q9NY99 539 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CHRNA1P02708 482 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CYP3A5P20815 502 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 IFNAR2P48551 515 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 VSTM1Q6UX27 236 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 PCGF5Q86SE9 256 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 SERINC5Q86VE9 423 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 HSPH1Q92598 858 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 CNPY3Q9BT09 278 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 WBP1LQ9NX94 342 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TBK1Q9UHD2 729 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 DERAQ9Y315 318 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNS3-201ENST00000304101 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CPP00450 1065 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CREB1P16220 341 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 GPD1P21695 349 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 FAM228AQ86W67 206 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 NOD1Q9Y239 953 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms