RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 GLI1P08151 1106 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RINLQ6ZS11 566 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 STMN3Q9NZ72 180 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SPASTQ9UBP0 616 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 HBP1O60381 514 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF9O75901 435 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TOMM70O94826 608 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PNPLA4P41247 253 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF6P49848 677 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MICALL2Q8IY33 904 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TADA1Q96BN2 335 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMTA2O94983 1202 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXD10P28358 340 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GLRBP48167 497 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRNB3Q05901 458 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SEZ6Q53EL9 994 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP9AO75110 1047 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX6P35712 828 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GHRP10912 638 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC24A2Q9UI40 661 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PRIM2P49643 509 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NCALDP61601 193 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TROAPQ12815 778 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 YIPF2Q9BWQ6 316 aa24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MLNP12872 115 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTFP26441 200 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MRNIPQ6NTE8 343 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NFYCQ13952 458 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NOTUMQ6P988 496 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM5Q71RC9 77 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MADDQ8WXG6 1647 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 E9PBE3 544 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS5O15539 181 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL41O60662 606 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TP53BP2Q13625 1128 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP42Q96MM3 310 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF181Q9P0P0 153 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 F8VZ95 297 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 F8W810 466 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP6O75344 327 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CLPTM1O96005 669 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMC2Q13753 1193 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RMND5AQ9H871 391 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRNA5P30532 468 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 DDIT4Q9NX09 232 aa24.97■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX5P50542 639 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GIT2Q14161 759 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 JADE3Q92613 823 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GPRASP2Q96D09 838 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CHST12Q9NRB3 414 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MMRN1Q13201 1228 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PWP1Q13610 501 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 KANSL1LA0AUZ9 987 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GZMAP12544 262 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP51A1Q16850 503 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MTERF3Q96E29 417 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 AMHR2Q16671 573 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.96■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NR5A2O00482 541 aa24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms