RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 SLC22A12Q96S37 553 aa26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 DUSP16Q9BY84 665 aa26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 KIF9Q9HAQ2 790 aa26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 HEBP1Q9NRV9 189 aa26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 COMMD8Q9NX08 183 aa26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.59■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 KCNJ18B7U540 433 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 CHADO15335 359 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 HDCP19113 662 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 GCNT1Q02742 428 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 FCHO2Q0JRZ9 810 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 KCNJ12Q14500 433 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 FBXO44Q9H4M3 255 aa26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PDF-201ENST00000288022 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 AVPR2P30518 371 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 SLC8A3P57103 927 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PRKCQQ04759 706 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 OVCA2Q8WZ82 227 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 ZFYVE19Q96K21 471 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 GMIPQ9P107 970 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.57■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PATJQ8NI35 1801 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 VDRP11473 427 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 SLC9A1P19634 815 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 ACO1P21399 889 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 CLCN5P51795 746 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 VWA3BQ502W6 1294 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TRIM65Q6PJ69 517 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TPRG1Q6ZUI0 275 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 IL37Q9NZH6 218 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 HESX1Q9UBX0 185 aa26.56■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 HHLA1C9JL84 531 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PAEPP09466 180 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PFKLP17858 780 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 STARD6P59095 220 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 KREMEN1Q96MU8 473 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 NDST4Q9H3R1 872 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TRPV5Q9NQA5 729 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 KIAA1257Q9ULG3 409 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa26.55■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 COL4A3Q01955 1670 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 KMT2EQ8IZD2 1858 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 KRT5P13647 590 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 AOC1P19801 751 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 MFAP3P55082 362 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PLCB2Q00722 1185 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TCP11X2Q5H9J9 407 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 ANKRD52Q8NB46 1076 aa26.54■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 MYO16Q9Y6X6 1858 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 FAM92AA1XBS5 289 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PI15O43692 258 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 OAS1P00973 400 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 CD72P21854 359 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 BCAT1P54687 386 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TYRO3Q06418 890 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 MIIPQ5JXC2 388 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 HECTD3Q5T447 861 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 GJB7Q6PEY0 223 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TTC30AQ86WT1 665 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TTC8Q8TAM2 541 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 SH3RF2Q8TEC5 729 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 FAM81BQ96LP2 452 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 FOXQ1Q9C009 403 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 RNF38Q9H0F5 515 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 GKN1Q9NS71 199 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 PIAS3Q9Y6X2 628 aa26.53■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.52■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 ARNTLO00327 626 aa26.52■■□□□ 1.84
PDF-201ENST00000288022 CYP26A1O43174 497 aa26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms