RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PEX1O43933 1283 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ABHD2P08910 425 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RAG1P15918 1043 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 OSBPP22059 807 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 NUMBP49757 651 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 GPC3P51654 580 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ZNF699Q32M78 642 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PAF1Q8N7H5 531 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 C7orf31Q8N865 590 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 FBXO27Q8NI29 283 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ADSSP30520 456 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RGS7P49802 495 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SLC15A2Q16348 729 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RAPH1Q70E73 1250 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SERAC1Q96JX3 654 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SYT11Q9BT88 431 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MX2P20592 715 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TYK2P29597 1187 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SERPINB5P36952 375 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PGBD4Q96DM1 585 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 FBXO40Q9UH90 709 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MMRN1Q13201 1228 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SULF1Q8IWU6 871 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 OR6Y1Q8NGX8 325 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PHF12Q96QT6 1004 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SOX13Q9UN79 622 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ECE2O60344 883 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CLPTM1O96005 669 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 FAM200BP0CF97 657 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 FGFR1P11362 822 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 NOMO3P69849 1222 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PRAMEP78395 509 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 LIN52Q52LA3 116 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CDKL2Q92772 493 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MMP19Q99542 508 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 GALNT8Q9NY28 637 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 M0QYV0 167 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 DCXO43602 365 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RAP1GAPP47736 663 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CRADDP78560 199 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ART3Q13508 389 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SATL1Q86VE3 508 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 HACE1Q8IYU2 909 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 UBA3Q8TBC4 463 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 EBF4Q9BQW3 602 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 A8MXQ7 604 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CD48P09326 243 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 GCNT1Q02742 428 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PHC3Q8NDX5 983 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CPT1BQ92523 772 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 GMCL1Q96IK5 515 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 FIZ1Q96SL8 496 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.7 ms