RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.08■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.08■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF197O14709 1029 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 MOSPD3O75425 235 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CEBPBP17676 345 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 YWHAQP27348 245 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CASP14P31944 242 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLA2G4AP47712 749 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 RGS7P49802 495 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PMF1Q6P1K2 205 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 IQCDQ96DY2 449 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.07■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 F11P03951 625 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 MMEP08473 750 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FERP16591 822 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TAF10Q12962 218 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 MEA1Q16626 185 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 IL37Q9NZH6 218 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 EHD2Q9NZN4 543 aa24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TADA3O75528 432 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDC25CP30307 473 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIF11P52732 1056 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZBED6P86452 979 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CYP4F8P98187 520 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TEAD2Q15562 447 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAB41Q5JT25 222 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMC6Q7Z403 805 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FGF13Q92913 245 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FBXO32Q969P5 355 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 GCNAQ96QF7 691 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PIK3R2O00459 728 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FGF19O95750 216 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC172P0C7W6 258 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 BMP1P13497 986 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASIC2Q16515 512 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF677Q86XU0 584 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 MYADMQ96S97 322 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 LHX5Q9H2C1 402 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ST7Q9NRC1 585 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 NOTCH4Q99466 2003 aa24.05■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM170AA1A519 330 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 GABBR2O75899 941 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CHRNB2P17787 502 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TKTL1P51854 596 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDR2Q01850 454 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADIGQ0VDE8 80 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRIM14Q14142 442 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 POTEHQ6S545 545 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 COMMD8Q9NX08 183 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.444e-14■■■□□ 16.1
SIGMAR1-201ENST00000277010 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP3Q9Y6I4 520 aa24.04■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM92AA1XBS5 289 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 LCP1P13796 627 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 FMO1Q01740 532 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 GMIPQ9P107 970 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDH7Q9ULB5 785 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 CEP83Q9Y592 693 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 MYH10P35580 1976 aa24.03■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L7P0C7H9 530 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 PDCLQ13371 301 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 HSFY1Q96LI6 401 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 SCML2Q9UQR0 700 aa24.02■■□□□ 1.44
SIGMAR1-201ENST00000277010 ABL1P00519 1130 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms