RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 IFT52Q9Y366 437 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 LRRC72A6NJI9 287 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CYP27B1O15528 508 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ATP5OP48047 213 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 INHBEP58166 350 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 EHHADHQ08426 723 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PAK1Q13153 545 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PIK3R3Q92569 461 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 STK32BQ9NY57 414 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 STAP2Q9UGK3 403 aa6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CLOCKO15516 846 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 BUB1O43683 1085 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PRKD3O94806 890 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CCNDBP1O95273 360 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 APOC1P02654 83 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 NUDT7P0C024 238 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 EPHB2P29323 1055 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PMLP29590 882 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CXCR5P32302 372 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CD79BP40259 229 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PRIM2P49643 509 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 MOGQ16653 247 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 HESX1Q9UBX0 185 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 UQCRBP14927 111 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 TNNI1P19237 187 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 DEFA6Q01524 100 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ARID5AQ03989 594 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PRKCQQ04759 706 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 NR5A1Q13285 461 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ITIH5Q86UX2 942 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 UCMAQ8WVF2 138 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 DPF3Q92784 378 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PEX13Q92968 403 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 FAF2Q96CS3 445 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 COPRSQ9NQ92 184 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ISPDA4D126 451 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PRDM1O75626 825 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 RPS6KB1P23443 525 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 HOXD10P28358 340 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 RAB25P57735 213 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 MYBPC1Q00872 1141 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 TBCCQ15814 346 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 SATL1Q86VE3 508 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 TREML1Q86YW5 311 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 COG8Q96MW5 612 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 WWP1Q9H0M0 922 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 CFLARO15519 480 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 HUS1O60921 280 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 GNA11P29992 359 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ERFP50548 548 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 DNM2P50570 870 aa6.98□□□□□ -1.29
PDGFRA-201ENST00000257290 ME3Q16798 604 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms