RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 HPDLQ96IR7 371 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 INTS13Q9NVM9 706 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 EHD2Q9NZN4 543 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 CPQQ9Y646 472 aa20.28■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 A0A0A0MRY4 1105 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 TRIM66O15016 1216 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 APODP05090 189 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 ENGP17813 658 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 TIE1P35590 1138 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 CYP27A1Q02318 531 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 RESTQ13127 1097 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 EOGTQ5NDL2 527 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 SV2BQ7L1I2 683 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 SLC32A1Q9H598 525 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.27■□□□□ 0.84
SLX1A-201ENST00000251303 ATRXP46100 2492 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 F8VP50 259 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MAP3K13O43283 966 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ADAM23O75077 832 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 DPP6P42658 865 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MAPK8P45983 427 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 C8orf34Q49A92 452 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 EMC10Q5UCC4 262 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 C8orf48Q96LL4 319 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ADH1CP00326 375 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TNNC2P02585 160 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PDGFRBP09619 1106 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ADH5P11766 374 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 GRIA2P42262 883 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 KDSRQ06136 332 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PIP4P1Q86T03 277 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 HMGB4Q8WW32 186 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 NME7Q9Y5B8 376 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CLIC4Q9Y696 253 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.25■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 IDEP14735 1019 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 HOXD12P35452 270 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TNFRSF4P43489 277 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TAF10Q12962 218 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SEMA3BQ13214 749 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.24■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PI4KAP42356 2102 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ABL1P00519 1130 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ITPKAP23677 461 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TXLNAP40222 546 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CACNA2D1P54289 1103 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SURF1Q15526 300 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms