RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 NOGQ13253 232 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 PDK2Q15119 407 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 KCNT1Q5JUK3 1230 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 PCGF5Q86SE9 256 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 HSFY1Q96LI6 401 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 PHACTR1Q9C0D0 580 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF487B1APH4 448 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 RASGRF2O14827 1237 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SPTLC1O15269 473 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SEPT4O43236 478 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 LSP1P33241 339 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 VPS41P49754 854 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 TFDP2Q14188 446 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 TRNP1Q6NT89 227 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 ACTL9Q8TC94 416 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SERPINB12Q96P63 405 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SMAPO00193 183 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SDC4P31431 198 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 PTPN9P43378 593 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 RGS7P49802 495 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 LILRA4P59901 499 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC14Q49A88 953 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 TRIB2Q92519 343 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD9-201ENST00000249499 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 ABHD2P08910 425 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 FGFR1P11362 822 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 PSMC4P43686 418 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 PLCB3Q01970 1234 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 SERINC5Q86VE9 423 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 HSPH1Q92598 858 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 PEBP4Q96S96 227 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 EPN3Q9H201 632 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 RARBP10826 455 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 GUCY1A3Q02108 690 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 RFX6Q8HWS3 928 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 SGK1O00141 431 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 TULP2O00295 520 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 PTGESO14684 152 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 MDM4O15151 490 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 ATP5DP30049 168 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 MAP2K2P36507 400 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 GPS1Q13098 491 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 BCAS4Q8TDM0 211 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 CENPTQ96BT3 561 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 TTC25Q96NG3 672 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 CD48P09326 243 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 CDH6P55285 790 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 PTGISQ16647 500 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 HAUS1Q96CS2 278 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 MCF2LO15068 1137 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 MMP13P45452 471 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 DPYSL3Q14195 570 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 CALN1Q9BXU9 219 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 TLDC2A0PJX2 215 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 GPR182O15218 404 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 GABBR2O75899 941 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 ACSL3O95573 720 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 LMO2P25791 158 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 FLT3LGP49771 235 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 SLC8A3P57103 927 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD9-201ENST00000249499 DYNLT1P63172 113 aa23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms