RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 CORO1BQ9BR76 489 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 HACD3Q9P035 362 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 NID2Q14112 1375 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 NDUFS3O75489 264 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 CHKAP35790 457 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ARSEP51690 589 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 GJA9P57773 515 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 EVX2Q03828 476 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ATG16L1Q676U5 607 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 RASGRF2O14827 1237 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SYN3O14994 580 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 WSCD1Q658N2 575 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 MED4Q9NPJ6 270 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 INSL6Q9Y581 213 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 C2orf81A6NN90 581 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 CCNE2O96020 404 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 BDNFP23560 247 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 POU5F1BQ06416 359 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ADIGQ0VDE8 80 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 FUT2Q10981 343 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 UGCGQ16739 394 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ZNF284Q2VY69 593 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 MTMR8Q96EF0 704 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SAMD11Q96NU1 681 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 MICAL2O94851 1124 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 USP17L7P0C7H9 530 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 RGS4P49798 205 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 IRF5Q13568 498 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 EMBQ6PCB8 327 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 GJB7Q6PEY0 223 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ZBTB18Q99592 522 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 NDUFAB1O14561 156 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ZBTB39O15060 712 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ATP9BO43861 1147 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SMIM24O75264 130 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 MYO1DO94832 1006 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 PYGLP06737 847 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 MMEP08473 750 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 DLK2Q6UY11 383 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 HSFY1Q96LI6 401 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 BAG5Q9UL15 447 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SNX24Q9Y343 169 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 TMEM247A6NEH6 219 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 F8VZ95 297 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 EPC2Q52LR7 807 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 NUP93Q8N1F7 819 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SPATA18Q8TC71 538 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 SUSD6Q92537 303 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 OGFRQ9NZT2 677 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 NFU1Q9UMS0 254 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 ESRRBO95718 433 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOG-201ENST00000229307 NFICP08651 508 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms