RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyp4f13Q99N19 523 aa8.24□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa8.24□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plxna4Q80UG2 1893 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Apol7aB2RT54 418 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trappc11B2RXC1 1133 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10134F6ZQC6 126 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Akap1O08715 857 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GrnP28798 589 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AdssP46664 456 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Usp10P52479 792 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CkbQ04447 381 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nsun7Q14AW5 724 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc66Q6NS45 935 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ift122Q6NWV3 1182 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hdac4Q6NZM9 1076 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc39a10Q6P5F6 833 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mpp4Q6P7F1 635 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Naa35Q6PHQ8 725 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Paqr9Q6TCG2 375 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cfap97Q6ZPR1 541 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Otop2Q80SX5 563 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pif1Q80SX8 650 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mical2Q8BML1 960 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc41a2Q8BYR8 573 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r213Q8R278 384 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krt79Q8VED5 531 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krt23Q99PS0 422 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lgals2Q9CQW5 130 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 2310003L06RikQ9CV82 495 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PgcQ9D7R7 392 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PpihQ9D868 188 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sgpp1Q9JI99 430 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Stx6Q9JKK1 255 aa8.23□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm12695A2AGB2 545 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem215A7E1Z1 235 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm13212B1ASQ7 799 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gprin2D3Z1D7 455 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm8871F7AXK2 190 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4933402N22RikF7D1B3 190 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r19G5E8G4 854 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr743L7N1Y2 311 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r71L7N2D8 855 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scrg1O88745 98 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 IapP03975 557 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Msh3P13705 1091 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Epb41l4aP52963 686 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Oaz1P54369 227 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fut7Q11131 389 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rtp3Q5QGU6 474 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GstcdQ5RL51 634 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CybbQ61093 570 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CochQ62507 552 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arhgap30Q640N3 1101 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 RragbQ6NTA4 374 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arl5cQ6P068 179 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 HomezQ80W88 542 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wscd1Q80XH4 572 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rnf168Q80XJ2 565 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ankfy1Q810B6 1169 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem169Q8BG50 297 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bnc2Q8BMQ3 1127 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pi15Q8BS03 258 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mtmr3Q8K296 1196 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kbtbd12Q9D618 625 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scn5aQ9JJV9 2019 aa8.22□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ralgps1A2AR50 585 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Skint8A7XV07 398 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm42957D6RFQ2 366 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm28043E0CXC2 719 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atf6F6VAN0 656 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 XntrpcF8VQM8 1264 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r1O70410 912 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AladP10518 330 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Meox1P32442 253 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mmp12P34960 473 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Usp30Q3UN04 517 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf653Q6YND2 615 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Jade2Q6ZQF7 829 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrsam1Q80ZI6 727 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spice1Q8C804 860 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 OgtQ8CGY8 1046 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpp40Q8R1F9 363 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Uroc1Q8VC12 676 aa8.21□□□□□ -1.09
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpap2Q8VC34 614 aa8.21□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.7 ms