RNA–Protein interactions for RNA: YOR119C

RIO1, Transcript of Serine kinase involved in cell cycling and pre-rRNA processing, yeast

Gene RIO1, Length 1,455 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO1	YOR119C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	SDC1	Q03323	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	MED6	P38782	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	MPC2	P38857	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	SPI1	P40092	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YNL194C	P40169	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	IES6	P32617	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YER187W	P40102	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	REE1	P40893	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	GLO1	P50107	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YGR164W	P53291	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	PRM7	Q12459	698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YBR209W	P38311	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	ATP15	P21306	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	DCV1	P43595	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	SFT1	P43682	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	NRM1	P53718	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YNL190W	P53872	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	TIM10	P87108	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	HAL1	Q01766	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	BLM10	P43583	2143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	CCW14	O13547	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YAR029W	P39549	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	HUR1	P45820	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIO1	YOR119C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	UBC4	P15731	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	PGU1	P47180	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	YGR219W	P53307	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	RRT1	P38192	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	MTC6	P38849	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	MRPS12	P53732	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	GAT3	Q07928	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	PEX17	P40155	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	MLF3	P32047	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	MSA2	P36157	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	YHR022C	P38763	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	CTR2	P38865	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	YML122C	Q03207	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	YFL019C	P43576	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	IMP2	P46972	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	PPT2	Q12036	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	YIL086C	P40503	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIO1	YOR119C	PIR5	P46999	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	MMS2	P53152	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	SHU1	P38751	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YFL015C	P43578	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	ATP20	Q12233	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YER084W	P40057	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YJR146W	P47174	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YNL046W	P53956	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	IRC21	Q04772	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	SPS100	P13130	326 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	KRE9	P39005	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	PEX22	P39718	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	ICY1	Q04329	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YKR045C	P36138	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	RNH203	Q12338	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	QCR8	P08525	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
RIO1	YOR119C	YMR295C	Q03559	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIO1	YOR119C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.3 ms