RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	PAU7	P39545	55 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	RSM18	P40033	138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	HNT2	P49775	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	ATP19	P81451	68 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	PPT2	Q12036	173 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	YKR045C	P36138	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	YHR173C	P38864	112 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	YGL088W	P53151	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXO1	YOR033C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
EXO1	YOR033C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	RPB9	P27999	122 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	AIM19	P40502	157 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	SPS100	P13130	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YDR274C	P87283	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	RNH203	Q12338	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	PET8	P38921	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	HUA1	P40325	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YML122C	Q03207	126 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YHR180W	P38868	163 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YAL064W	P39711	94 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YGR050C	P53231	118 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
EXO1	YOR033C	YGL193C	P53097	103 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	MTC6	P38849	526 aa		4.05	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	CTR2	P38865	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	TIM22	Q12328	207 aa		4.05	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YEL045C	P32616	141 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	HUR1	P45820	110 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	NCA3	P46955	337 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	MDM35	O60200	86 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	API2	Q04413	109 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	MPC2	P38857	129 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	TOM7	P53507	60 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	SPG4	Q04438	115 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	YKR032W	P36127	104 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	PCP1	P53259	346 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	CRC1	Q12289	327 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EXO1	YOR033C	LDB16	P25587	256 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YHR022C	P38763	256 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	SPI1	P40092	148 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	DCV1	P43595	202 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	IMP2	P46972	177 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YAL065C	O13511	128 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	SPG1	P50088	95 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	ATP20	Q12233	115 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YOR314W	Q12506	109 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	ECO1	P43605	281 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YPS5	P53057	165 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YLR194C	Q05777	254 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	VPS68	Q12016	184 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	TIM17	P39515	158 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YHP1	Q04116	353 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	PCL5	P38794	229 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YER135C	P40082	130 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YLR162W	Q06235	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	FIT2	Q08906	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YHL005C	P38752	130 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	MIG3	P39943	394 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	MGR2	Q02889	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YOL118C	Q08259	102 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	COA3	Q3E7B2	85 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EXO1	YOR033C	AGA1	P32323	725 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.2 ms